Bộ máy tổ chức của Công ty TNHH Một thành viên Du lịch Công đoàn Đà Nẵng được thiết kế tinh gọn, khoa học và vận hành theo cơ chế chỉ đạo trực tiếp kết hợp phối hợp nghiệp vụ gián tiếp xuyên suốt:

1. BAN LÃNH ĐẠO VÀ KIỂM SOÁT
- Chủ tịch Công ty: Cấp quyết định cao nhất về chủ trương, chiến lược và định hướng phát triển tổng thể.
- Giám đốc Công ty: Ban điều hành trực tiếp, toàn diện mọi hoạt động kinh doanh và vận hành của Công ty.
- Kiểm soát viên chuyên trách: Thực hiện nhiệm vụ kiểm soát, giám sát độc lập tính tuân thủ và tài chính theo quy định.

2. CÁC PHÒNG BAN CHỨC NĂNG
Chịu sự quản lý trực tiếp của Giám đốc Công ty; tham mưu, hỗ trợ quản lý nghiệp vụ chuyên môn và phối hợp gián tiếp với các đơn vị:
- Phòng Kế toán: Quản lý tài chính, kiểm soát chi phí, hạch toán kế toán và phối hợp nghiệp vụ kế toán với cơ sở.
- Phòng Nhân sự - Thị trường: Quản trị nguồn nhân lực, lao động tiền lương, nghiên cứu phát triển thị trường và tiếp thị.

3. CÁC ĐƠN VỊ TRỰC THUỘC (KHỐI KINH DOANH VÀ VẬN HÀNH)
Chịu sự quản lý và chỉ đạo trực tiếp từ Giám đốc Công ty; các đơn vị có cơ cấu điều hành riêng và phối hợp tương hỗ:

* Khách sạn Công đoàn Thanh Bình (Ban điều hành: 01 Giám đốc, 01 Phó Giám đốc):
- Tổ Lễ Tân
- Tổ An Ninh
- Tổ Hành Chính
- Tổ Buồng
- Tổ Bàn - HT
- Tổ Bếp

* Trung tâm Điều Hành Du lịch Công đoàn (Ban điều hành: 01 Giám đốc, 01 Phó Giám đốc):
- Phòng KD Trong Nước
- Phòng KD Quốc tế
- Phòng Điều Hành
- Phòng Hướng dẫn
- Phòng Sự Kiện
- Phòng Vé
- Đội xe Du Lịch